La cause exacte d'un nævus de Spitz n'est pas entièrement comprise. La génétique, l'exposition aux UV et les changements hormonaux (comme la puberté ou la grossesse) sont supposés jouer un rôle. La plupart des cas apparaissent sans déclencheur clair.
Un nævus de Spitz typique est considéré comme bénin et présente un risque très faible de se transformer en mélanome. Le principal risque est de manquer un mélanome qui lui ressemble, c'est pourquoi toute lésion changeante ou atypique doit être vérifiée et souvent retirée. Un traumatisme, une forte exposition aux UV ou une irradiation de la zone sont des raisons d'être plus prudent et de consulter un médecin.
Le principal traitement pour un nævus de Spitz est l'ablation chirurgicale avec une petite marge de peau normale, suivie d'un examen histologique pour confirmer le diagnostic. Les méthodes destructives comme le laser ou la congélation ne sont pas recommandées car elles détruisent le tissu et rendent le diagnostic précis impossible. Si la lésion est typique et stable, certains médecins peuvent suggérer une surveillance attentive au lieu d'une ablation immédiate, surtout chez les enfants.