Onykomykoosin aiheuttavat sienet, jotka tunkeutuvat kynsilevyyn ja kynsipetiin, useimmiten dermatofyytit kuten Trichophyton rubrum. Infektio alkaa yleensä, kun sienet pääsevät kynnen tai ympäröivän ihon pienistä halkeamista, erityisesti lämpimissä, kosteissa ympäristöissä. Paljain jaloin kävely yleisissä suihkuissa, tiukkojen kenkien käyttäminen tai jalkasieni lisäävät kynsi-infektion todennäköisyyttä. Heikentynyt immuniteetti, diabetes ja huono verenkierto helpottavat sienen kiinnittymistä.
Olet suuremmassa riskissä onykomykoosille, jos olet vanhempi, sinulla on diabetes, huono verenkierto tai heikentynyt immuunijärjestelmä, tai jos sinulla on usein hikiset jalat tai jalkasieni. Tiukat, hengittämättömät kengät, paljain jaloin kävely julkisissa suihkuissa tai uima-altaissa ja kynsitrauma urheilusta tai huonosti istuvista kengistä lisäävät myös riskiä. Ihmiset, jotka työskentelevät märissä ympäristöissä tai käyttävät yhteisiä pukuhuoneita, ovat enemmän alttiina. Kynsisienen perhehistoria ja asuminen jonkun kanssa, jolla se on, voivat myös lisätä mahdollisuuksiasi.