ไม่มีสาเหตุที่แน่นอนเพียงอย่างเดียวของมะเร็งเซลล์ฐาน แต่การสัมผัสรังสียูวีระยะยาวจากแสงแดดหรือเตียงอาบแดดเป็นตัวขับเคลื่อนหลัก การแผ่รังสีไอออไนซ์ สารเคมีที่เป็นอันตรายบางชนิด และการบาดเจ็บที่ผิวหนังเรื้อรังก็เพิ่มความเสี่ยงเช่นกัน โดยเฉพาะในคนผิวขาว
มะเร็งเซลล์ฐานแทบจะไม่แพร่กระจายไปทั่วร่างกาย ดังนั้นความเสี่ยงหลักคือการทำลายผิวหนังและเนื้อเยื่อที่ลึกลงไปในท้องถิ่นหากการรักษาล่าช้า ผู้ที่เคยเป็นมะเร็งเซลล์ฐานมีโอกาสสูงที่จะเกิดเนื้องอกใหม่และควรตรวจผิวหนังเป็นประจำ
การรักษาหลักสำหรับมะเร็งเซลล์ฐานคือการกำจัดเนื้องอกออกทั้งหมดด้วยการผ่าตัดโดยมีขอบผิวหนังที่แข็งแรง ในบางกรณี การฉายรังสีหรือการรักษาเฉพาะที่ที่เลือกอย่างระมัดระวังอาจถูกนำมาใช้ แต่เป้าหมายหลักคือการกำจัดออกทั้งหมดเพื่อลดความเสี่ยงของการเกิดซ้ำ